Un mulplexeur est une partie de solution, mais ne me permet pas détecter quel signal j'acquiers.
Pour ceux que ca intéresse, voici une solution proposée sur un autre forum qui correspond à mon projet.
On utilise un multiplexeur avec deux fois plus d'entrées que nécessaire.
Sur la première entrée, on met un signal à la masse.
Ensuite, on place notre signal 1, suivant d'un signal à Vcc, notre signal 2, Vcc et ainsi de suite, une alternance entre un signal et Vcc.
Notre signal ne doit pas atteindre la masse, ni Vcc.
Un compteur change la position de l'entrée à chaque période, tel que la période est supérieure au temps d'aquisition de la carte.
Pour savoir quel signal on acquiers, on sait que dès qu'on a un signal 0v (la masse), le suivant sera le signal1... le signal Vcc nous permet de savoir que l'on passe au signal suivant
Merci à ceux qui se sont intéressés au problème !